1 - document.getElementById('minhadiv') tem um esforço muito maior que $('#minhadiv');
2 - Dito isto, não vejo problema em se utilizar qualquer das 2 abordagens, mas vamos admitir: o jQuery deixa a programação muito mais fácil e rápida.
Respondendo a "Essas comparações não fazem sentido e é por iss..." dentro da publicação Tecnologias Velhas
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