Principalmente no Pix, o nome e sobrenome do titular acabam aparecendo para quem realiza o pagamento, o que não combina com a identidade da marca.

Sim, Quando você faz um pagamento você precisa saber para onde está indo esse pagamento.

A única forma que eu conheço de alterar isso é simplesmente alterando o nome fantasia no CNPJ, o que Não combina com MEI.

Outra forma seria usar uma plataforma de intermediação de pagamentos, como stripe, mas aí apareceria o nome da plataforma e não o que você quer