Eu tenho o mesmo problema, mas eu resolvi gastando muito tempo organizando cada coisa no seu lugar. Eu trato o meu Notion como um software: sempre vou querer guardar algo novo e com pouco ou nenhum padrão.
As páginas ficaram +- assim:
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pessoal -> tem pagina pra anime que quero ver, filmes, jogos, ideias de projetos pessoais, lista de desejos, receitas de cozinha, técnica, argumentos, família, ...
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computaçao (70% de tudo tá aqui) -> Database com varias views (conhecimento geral, sites úteis, canais do YouTube, como fazer isso no <insira algum software>, linguagens de programação, frameworks, matemática, ...); Eu gosto de usar a views cards pra subdividir uma view em tópicos (sites que processam imagem, IAs free na web que se subdivide por text2video, etc....)
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faculdade -> toggles pra cada semestre e uma página pra cada disciplina. sub páginas para tópicos estudados. Headers para assuntos e links relacionados, tipo a grade de horário atual, sala de cada disciplina.
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fazer buscas por texto (ctrl+k) é um pouco lento e as vezes eu considero migrar pro Obsidian pra ver se melhora. Mas eu lembro onde coloquei cada tópico e procuro ou adiciono com tanta frequência que acaba não dando vontade.