Como outros já falaram, vai de caso a caso: se precisa de mobilidade, de desempenho ou de ambos.
No meu trabalho eu tenho um notebook e um monitor; em casa, tenho um computador com um monitor bem maior e um notebook mais antigo, usado apenas em caso de emergência.
No meu caso, o que sinto falta é de uma segunda tela em casa.
Se não precisar de mobilidade, o desktop oferece mais vantagens; se precisar, um notebook com mais desempenho resolve.