Olá Selitto, obrigado por analisar o projeto e tirar tempo. Tenha certeza que vai me ajudar bastante nas próximas atualizações 😃

O input para nova nota ocupa bastante espaço, poderia ser apenas um ícone de + na barra de opções e quando clicar abre esse input todo em uma modal.

Realmente, o input (Campo de Nota) ocupa espaço e poderia ser apenas um ícone de "+". Até aproveitando deixe-me explicar esse ponto: ser assim isso foi uma decisão proposital: tornar o Campo de Nota o elemento central de design. Vamos dizer que ele é a "expressão" do design do noteous. Por isso ele tem essa forma e ocupa esse espaço (tanto é que o ícone do aplicativo é exatamente o Campo de Nota com o Botão de Prioridade).
E aproveitando ainda: Na 2ª Geração estou planejando fazer grandes melhorias e o Campo de Nota vai ser meu foco. Então, com certeza vou levar seu feedback em conta.

Use o IndexedDb do navegador para salvar as notas e localStorage somente para as settings;
Limite a quantidade de caracteres para a nota, eu coloquei texto de 1,5MB e acabei com limite do localStorage rapidamente;

Sensacional vc testar isso e chamar atenção. Com o IndexedDB vai melhorar bastante.

Os ícones devem ter um tooltip para indicar que ação eles fazem;

Sabe, sobre isso tenho tentado encontrar o equilibrio entre um ícone falar por si mesmo e exibir um tooltip para indicar a ação.
Por um lado, uma legenda pode poluir visualmente, por outro lado, não exibir uma legenda pode dificultar saber qual ação o botão faz.

São detalhes importantes para pensar mesmo 😃