Passei por essa dor e não tinha ferramenta boa para ajudar a resolver.
Atualmente não lido com isso (pelo menos em frequência muito menor).

Hoje ou quando lidava mais com esses casos, eu fazia/faço "na mão" mesmo.

A minha necessidade seria para comparar relatórios, extrair os dados da tabela e comparar com outros dados. Mas todos são tabelas bem complexas, às vezes com grades, às vezes com espaços/tabulações...