Testei as duas hoje na 2.1.283.

Com os dois arquivos na pasta, só o CLAUDE.md entra e o AGENTS.md fica de fora, então quem mantém conteúdo diferente nos dois perde as instruções do AGENTS.md sem perceber. Com @AGENTS.md dentro do CLAUDE.md, aparece uma vez só. Seu symlink também não duplica. O fallback só roda quando não existe CLAUDE.md e dá pra desligar em /config.

Valeu pelo link, foi ele que me fez parar e testar.