Concordo com a distinção: o @AGENTS.md o Claude Code expande quando abre a sessão, enquanto o padrão B depende do agente cumprir uma frase em linguagem natural.

Sobre a duplicação, testei hoje na 2.1.283. Não duplica. O AGENTS.md só é lido sozinho quando a pasta não tem CLAUDE.md, e tanto com o stub de 11 bytes quanto com symlink o token de teste que coloquei no AGENTS.md apareceu uma única vez.

Quem mudou de verdade foi o padrão C, e meu post envelheceu antes de sair: os dois repos que eu tratei como "fora do Claude Code" agora são lidos por ele.