Como disse o @engineer, acho que seu foco deveria ser automatização, criando um robôs, que lancem os fretes nos sistemas da transportadoras maiores.

Dá um pouco mais de trabalho, mas é reaproveitável e dependendo do volume q vc atingir, pode até 'forçar' as transportadoras a disponibilizar uma API.

E em paralelo, conforme for tendo mais clientes, insista com as transportadoras maiores pra disponibilizarem APIs...