O Whatsapp muito dificilmente bane um número por usar api paralela, ele bane pela forma que é usado o aplicativo e isto independente se está usando a api oficial, paralela ou enviando direto do whatsapp.
Pode utilizar tranquilamente api´s paralelas, eu recomendo vc fornecer as duas opções para o seu cliente, que é utilizar uma api paralela onde você custeia os valores e repassa para ele no valor da mensalidade ou ele utilizar a api oficial passando as credenciais.