Se você faz um microsaas web por exemplo, ele pode rodar tanto no desktop, quanto no mobile, isto independente da plataforma.
Se cria um app, ele fica restrito a plataforma mobile e ai vem o ponto de você ver se consegue criar um app para androie e iOS ou somente para android.

Creio que a melhor solução é criar um microsaas web e depois criar os aplicativos conforme a necessidade e os usuários que você tem.