Faz bastante sentido. Em sistemas ERP legados, principalmente com limitações como os 32 caracteres do Firebird 2.5, as abreviações acabam sendo uma solução prática e consistente.
O ponto interessante é que, quando existe um padrão bem definido como Cd_cli, Nm_cli e Cd_ped_fut o nome deixa de ser apenas uma abreviação e passa a funcionar como uma espécie de linguagem do sistema.
No caso do MigraFlow, esse contexto seria muito importante para evitar que o agente interprete esses nomes como ambíguos ou proponha renomeações inadequadas. Uma possibilidade seria informar um dicionário de abreviações e regras do ERP, permitindo distinguir entre uma transformação segura de nomenclatura e uma decisão que precisa de revisão humana.
Também concordo que, se não houvesse essa limitação histórica, nomes mais explícitos seriam melhores para manutenção e integração com outros sistemas. Mas, quando existe um padrão consistente, documentá-lo pode ser tão importante quanto aumentar o tamanho dos nomes.