Interessante esse tópico, atualmente eu trabalho em uma fintech, porém como ela é repleta de produtos financeiros não tenho ciência de como funciona para tudo.
Bom tem coisas que não podem ser faladas publicamente até onde sei, então irei evitar detalhes, mas sobre o primeiro questionamento o Bacen que controla tudo isso, a instituição financeira apenas reporta as transferências e repassa os saldos em momentos específicos depois de retirarem suas taxas.
Sobre o segundo ponto, Não, muitas instituições financeiras usam outras empresas que são regularizadas pelo Bacen para poder operar, se você pesquisar na internet quem são as empresas regularizadas vai achar umas 6, então todas as outras que vendem soluções financeiras tem contratos com elas para poderem operar.