Olha, analista de suporte PJ normalmente (pode não ser seu u caso) que está ganhando é a empresa e não você. Porque digo isso? É um cargo que normalmente exige horário fixo, com pausas fixas etc, aí não é PJ mas sim CLT que a empresa não quer pagar imposto.
Como PJ você é uma empresa que foi contratada para entregar um determinado tipo de serviço cujo "tempo" é determinado. Empresa não vende horário fixo, vende um determinado serviço que pode ser feito a qualquer hora contando que seja feito. Claro que existem empresas como "telemarketing" que precisam garantir o horário, porém não a pessoa. Uma empresa pode romper o contrato com outra a qualquer momento, sem grandes consequências (salvo quando garantido em contrato, com cláusulas específicas sobre aviso prévio, multa etc).
CLT ganha "menos", na teoria. No fim do mês o que chega na sua conta é menos mesmo. Aí tem o 13, então você pega esse valor, divide por 12 e adiciona no valor do seu salário "mensal". Tem as férias, mesma coisa (PJ não tira férias, raros os casos, e se tira não ganha nada a mais). Tem o FGTS, não vem pro seu bolso, não é muito, mas tá lá, você precisa contabilizar de certa forma. Tem os benéficos em alguns casos, pode ou não valer a pena (vale alimentação alivia a compra de casa, plano de saúde te dá uma qualidade de vida melhor). Se tu ficar doente, sofrer um acidente, etc não vai morrer de fome, pode apertar mas não vai deixar de entrar dinheiro. PJ tu fica desamparado. Se perder o emprego e não for por justa causa, tem o seguro desemprego pra dar uma amenizada até achar outro.
PJ de verdade você pode ter 2, 3, 4 trampos se quiser, contando que de conta de entregar tudo no prazo e com qualidade. Pode resolver qualquer coisa durante o dia a hora que quiser. Se for MEI perde praticamente zero com imposto.
Agora, o que é melhor? Depende muito do seu perfil, se onde você quer chegar, da educação financeira que você tem, das reservas que consegue manter, do seu plano de carreira. Se onde você está não vai te levar a lugar nenhum, você não vai crescer mais, etc, de certa forma isso não é legal, Daqui um tempo vão olhar para seu currículo e avaliar como "porque continuou como suporte por tanto tempo?" Ou então você poderia estar já ganhando mais mas ficou parado no lugar, etc.
Pensa no hoje (afinal você tem contas para pagar), mas pensa também no amanhã (faz uma lista dos "e se acontecer isso") e escolhe quais riscos você e quais benefícios você tem em cada um e qual você valoriza mais ou está disposto a arriscar. Não tem resposta certa, isso dependente de você e sua esposa, como vocês querem planejar o futuro. Nada te impede de ter um trampo CLT e um contrato PJ tb em muitos casos (se você quiser dar uma acelerada na grana e estiver disposto a perder umas noites). Conheço muita gente da área de TI que dá isso.
Enfim amigo, não olha só pra grana imediata, olha pro teu futuro, que pode ser CLT ou PJ mesmo, mas que seja olhando o todo da tua vida. É quanto as vagas, empresa escolhe mas você também pode escolher, não é porque se candidatou a uma vaga que é obrigado a aceitar se não é o que você espera. Escolhe umas, tenta se candidatar, tenta mandar em vaga mais alta do que você tem hoje, vê os benefícios, vê se se sente seguro e troca quando achar que faz sentido para você e a família que está construindo.