Eu trabalho a 21 anos com erps e penso que a melhor solução é realmente existir uma separação clara da parte fiscal do resto do Erp, até porque no fundo quando um erp tem toda parte fiscal o que existe é um módulo totalmente separado dentro do erp que duplica todas as informações de outros módulos e permite ajustes manuais e neste sentido poderia ser um software separado.
O número de mudanças tributárias é muito grande e acaba por atrapalhar todo o resto do sistema que poderia agregar bem mais ao negócio do cliente, mas isso nao ocorre devido também a perda de tempo com a burocracia fiscal.
A contabilidade por sua vez é estável e nao muda.
Agora o que falta é os sistemas fiscais terem uma integração na parte de calculo de impostos com o erp. Nao faz sentido os dois sistemas calcularem impostos e classificarem documentos fiscais.
Esse é o ponto que tem de ser mudado.
Mas por algum motivo os sistemas contáveis nao se abrem a isso. Sao muito protecionistas.